扩增子测序(Amplicon Sequencing)是一种靶向高通量测序技术,主要用于研究复杂微生物群落中的物种组成和多样性。它通过扩增并测序特定的保守基因区域(如细菌的16S rRNA基因、真菌的ITS区域、原核生物的18S rRNA基因或特定的功能基因等),来识别和分类环境中的微生物,能够用于微生物的分类鉴定和系统发育研究,广泛应用于微生物生态学研究中。近年来随着高通量测序技术及数据分析方法的不断进步,大量基于这些基因的研究使得微生物生态学得到了迅速发展。
三代全长cDNA
凭借在 DNA 和 RNA 测序方面的丰富经验、对分子生物学的深刻理解以及丰富的生物信息学知识,罗宁生物一直与各大高校以及生物技术领域的科研者者合作。我们能够在以下领域协助您的项目:
三代全长转录组
三代重测序(Whole Genome Sequecing,WGS)是指利用长读长测序技术对已有参考基因组序列的物种进行全基因组DNA测序,从而获得个体相对于参考基因组的突变信息(如SNP、InDel、结构变异等)。相对于二代测序技术,三代测序(特别是长读长的Oxford Nanopore测序技术)能够更好地解析SV突变,为筛选突变基因和结构、研究发病及遗传机制 ,以及推断种群迁徙和进化等提供重要信息。
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细菌基因组研究通常通过对细菌进行基因组测序与组装,获得其完整的基因组序列,并进一步开展结构与功能层面的分析。根据研究的精细程度不同,细菌基因组可分为框架图(draft genome)和完成图(complete genome,无缺口)。
扩增子测序(Amplicon Sequencing)是一种靶向高通量测序技术,主要用于研究复杂微生物群落中的物种组成和多样性。它通过扩增并测序特定的保守基因区域(如细菌的16S rRNA基因、真菌的ITS区域、原核生物的18S rRNA基因或特定的功能基因等),来识别和分类环境中的微生物,能够用于微生物的分类鉴定和系统发育研究,广泛应用于微生物生态学研究中。
GSS(GS-Sequencing)扩增子测序是罗宁生物开发的专利技术,用于解决植物内生菌高通量测序中宿主质体污染的问题。其聚焦于植物根、茎、叶等组织中的内生细菌和真菌群落,主要通过实验过程中屏蔽宿主质体DNA,只扩增微生物16S rRNA基因和ITS序列的测序方式,全面揭示植物体内微生物的多样性、组成与生态功能。相比常规环境微生物测序,GSS在样本处理、污染控制、引物设计等方面进行了专门优化,更适用于植物组织内微生物的低丰度、高背景检测需求,广泛应用于农业、林业、中药材研究等领域。
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