环境微生物多样性

服务与产品

  • 扩增子测序
  • 宏基因组测序
  • 宏转录组测序

微生物在各类环境中分布广泛,进化历史久远,种类繁多,在环境、医药、健康、工业、采矿和考古等领域都有重要作用。高通量测序技术的发展为微生物学提供了革命性的研究方法。罗宁生物生物利用高通量测序平台和经验丰富的分析团队,为微生物学研究领域的客户提供从菌群宏基因组到个体细菌基因组测序的全套解决方案。

扩增子测序

扩增子测序主要通过对特定长度的 PCR 产物进行测序分析,对于环境样本来说,16S/18S/ITS/28S、功能基因及其它标志基因等扩增子高通量测序是研究环境微生物多样性及群落组成差异的重要技术手段之一。 根据不同的研究目的和需求,罗宁生物可提供多种扩增子产品:16S rDNA测序、18S rDNA测序、ITS测序、28S rDNA测序、功能基因区域测序及GS sequencing。

16S测序

18S/ITS测序

功能基因测序

GS-Sequencing

宏基因组测序

宏基因组测序是对环境样品中所有微生物的基因组DNA进行高通量测序和分析,因而能够解释微生物群落多样性、种群结构、进化关系、功能活性及其与环境条件之间的相互关系,从而极大地扩展了微生物学的可研究范畴。宏基因组测序摆脱了传统研究中微生物分离培养的技术限制,直接提取环境样本总 DNA 进行测序,具有通量高、信息全等特点,在鉴定低丰度的微生物群落、挖掘基因资源方面具有很大优势,基于测序技术和生物信息学的快速发展,宏基因组技术优势在微生物研究领域中愈发明显,应用范围愈发广泛。

宏转录组测序

宏转录组是指从整体水平上研究特定环境,特定时期微生物群落全部的基因组转录情况以及转录调控规律,它以微生物群落中的全部 RNA 为研究对象,避开了微生物分离培养困难的问题,能有效的扩展微生物资源的利用空间。相较于宏基因组,宏转录组能从转录水平研究复杂的群落变化,并能够探索物种间的相互作用规律以及发掘新的基因资源等。




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