动植物基因组测序

服务与产品

  • 全基因组重测序
  • 简化基因组测序
  • 混池测序
  • InDel扩增子测序

基于全基因组重测序技术,可快速进行资源普查筛选,寻找大量遗传变异,实现遗传进化分析及重要形状候选基因的预测。

全基因组重测序

全基因组重测序是对已知基因组序列的物种进行不同个体的基因组测序,并在此基础上对个体或群体进行差异性分析。全基因组重测序的个体,通过序列比对,可以找到大量的单核苷酸多态性位点(SNP),插入缺失位点(InDel,Insertion/Deletion)、结构变异位点(SV,Structure Variation)位点和拷贝数变异位点(CNV,copy number variation)。罗宁生物通过生物信息分析发现不同个体基因组间的结构差异, 同时完成注释。

简化基因组测序

高密度SNPs标记开发的基本条件和设计理念是所获得的片段尽量在基因组上分布均匀,通过测定少量代表全基因组信息的序列获得的成千上万SNPs标记。首先要利用生物信息学方法对目标物种参考基因组(或已知BAC序列)进行系统分析,根据基因组GC含量、重复序列情况和基因特点等信息,选择相应的限制性酶以及测序文库类型,以保证分子标记的密度、均匀性、效率满足遗传分析和分子育种的需要。

混池测序

针对性状分离的群体通过群体DNA的混合建库及亲本基因组的重测序,挖掘性状连锁相关的候选区域,定位目标功能基因,同时检测物种高密度的分子标记,为后续育种工作提供极具针对性的可靠数据。

InDel扩增子测序

插入缺失突变(InDel,insertion and deletion)是较难检测到的,当人们在基因组数据中寻找变异时,InDel区域总在难以触及的地方。同时,InDel事件复杂多变,而且往往高度重复,传统检测方法已渐渐满足不了InDel的研究需求。罗宁生物基于高通量二代测序技术及优异的信息学分析基础,可为客户提供多种定制分析,为您在InDel精确分析中提供最优解决方案。TALEN、Cas9及NgAgo等定点修饰技术研究好助手。




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