罗宁生物全长扩增子SMRT"高分辨率”测序解析已推出


       微生物核糖体小亚基SSU rRNA可变区的测序分析方法被广泛应用于环境微生物多样的研究,16S rRNA基因、18S rRNA基因和ITS基因也是进行系统发育和分类研究时最常用的分子标记物。近年来,随着高通量测序技术及数据分析方法的不断进步,大量基于扩增子测序技术的研究在微生物生态学中得到了迅速的发展。但限于Illumina平台的短片段测序长度的限制,基于该平台对部分高变区的测序分析很难将物种精确鉴定到属以下的分类水平。

       罗宁生物基于PacBio SMRT单分子测序技术(Single molecule real-time sequencing)的超长读长优势,开发了覆盖全长核糖体小亚基16S rRNA基因、18S rRNA基因和ITS基因的高通量测序分析技术,解决了Illumina平台短读长的只能针对部分可变区进行分析的技术难题,并通过其独有的环形一致性测序模式(Circular-consensus sequence,CCS)极大的提高了单碱基测序的准确率。在最优成本的基础上,实现了菌群分类的精准鉴定。与此同时,基于CCS Reads的原始错误矫正,可获取精确度在99%以上的全长序列,在现有数据库不断更新的基础上极大提高我们对更精细分类水平解析的能力。


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